MYSA har egne små helsestasjoner hvor det tilbys gratis rådgiving og testmuligheter for HIV, aids og andre seksuelt overførbare sykdommer. Her kan ungdommene også få gratis prevensjon. Helsestasjonene blir også en arena for råd/veiledning ved narkotika eller alkohol-misbruk, for de som utsettes for vold i familien eller seksuelt misbruk. Noen kvelder/netter reiser de ut til områder der de prostituerte tilbyr sine tjenester for å gi disse "midnight workers" samme tilbud og støtte. 

Der er MYSAs egne ungdommer som kurses for å utføre dette viktige arbeidet. 

​​

MYSA har etablert et samarbeid med Leger Uten Grenser i tillegg til lokale helseinstitusjoner og henviser videre dit når mer ekspertise og behandling kreves.